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上海生科院發表環形RNA研究綜述文章

作者: 2016年03月04日 來源:互聯網 瀏覽量:
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2月25日,中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所研究員陳玲玲受邀在Nat Rev Mol Cell Biol 上發表題為The biogenesis and emerging roles of circular RNAs 的綜述進展論文

  2月25日,中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所研究員陳玲玲受邀在Nat Rev Mol Cell Biol 上發表題為The biogenesis and emerging roles of circular RNAs 的綜述進展論文,對環形RNA這一類具有特殊結構的RNA分子新家族的生成加工及潛在生物學功能進行了系統總結和研究展望。

  傳統的編碼和非編碼RNA研究主要針對呈5→3極性的線形RNA開展,而非poly(A)轉錄組測序結合全新的計算生物學算法揭示了生物體內存在大量的環形RNA,主要包括內含子來源和外顯子反向剪接來源的兩類環形RNA。陳玲玲研究組與中國科學院-馬普學會計算生物學伙伴研究所楊力研究組合作,與國際上其他研究組共同闡明了外顯子環形RNA的產生需要經典的剪接復合體,并同時受到順式作用元件和反式作用因子的調控。更為重要的是,由于其結構的穩定性,這些環形RNA在體內可以長期穩定存在,具有成為新型生物標志物的潛在應用價值。雖然大部分環形RNA的功能作用仍有待進一步揭示,已有的研究表明環形RNA可以通過結合RNA聚合酶II在轉錄水平、或作為分子海綿結合miRNA在轉錄后水平調控基因表達。迄今為止,組學研究預測到多達幾十萬條的環形RNA,深入揭示它們在不同條件下的生物加工特性及其潛在功能作用,將進一步豐富人們對環形RNA這一類RNA新分子的認知和轉化醫學應用。

  陳玲玲研究組從事長非編碼RNA研究,近年來揭示細胞核內非編碼RNA參與基因表達調控的機制(Genes Dev, 2015; Cell Res, 2014, 2015);也首次創建非poly(A)轉錄組純化體系(Genome Biol, 2011),系統發現一系列新RNA分子家族,揭示其生成加工機制及生物學功能,其中包括sno-lncRNAs (Mol Cell, 2012; NAR, 2015)、內含子來源環形RNA (Mol Cell, 2013)及外顯子反向剪接環形RNA (Cell, 2014)。相關研究極大地推動了長非編碼RNA和環形RNA研究領域的發展。



 

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標簽:環形RNA

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