全球化工设备网—化工设备,日韩在线成人,化工机械,一区二区电影,制药设备,亚洲欧美日韩系列,环保设备的专业网络市场。

當前位置:全球化工設備網 > 資訊 > 行業動態 > 正文

基因科技:基因檢測算法將代替生物統計模型

作者: 2017年01月13日 來源:化工儀器在線 瀏覽量:
字號:T | T
可能改變未來的一項技術之一是基因科技,據麥卡錫去年發布的一份報告,預計到2025年,全球將會累計產生10億人次的全基因組數據,而檢測基因的成本將下降到接近為0。在可以預見的未來,基于深度學習的基因檢測算法將

  可能改變未來的一項技術之一是基因科技,據麥卡錫去年發布的一份報告,預計到2025年,全球將會累計產生10億人次的全基因組數據,而檢測基因的成本將下降到接近為0。在可以預見的未來,基于深度學習的基因檢測算法將會有更大的施展空間。 
 考慮到每一個人的全基因組數據將會達到100G,如何對這些海量數據的解讀,現有的生物信息方法基于統計學模型,而12月20日來自谷歌子公司Deepmind的科學家發表了一篇論文,提出一個名為DeepVariant的檢測工具,使用深度神經學習中的卷積神經網絡CNN來檢查基因組上的單堿基突變(SNP)和小的插入缺失(Indel),其準確性超越了當前主流的生物信息學軟件GATK。而在12月30日,來自康奈爾大學的另一組研究者又獨立的發表了一篇用類似方法檢測基因變異的軟件。兩篇論文的爆發式出現,彰顯了深度學習在基因組數據挖掘領域的巨大潛力。
 每個人的體內都包含著3億對堿基,這些堿基的排列方式決定了我們從生老病死的方方面面,找到了你的基因組的差異之處,可以幫助我們了解我們的疾病的易感性,也可以知道我們的個體特征。對基因數據的傳統分析方法,基于貝葉斯統計和專家的經驗,針對不同的檢測物種,需要很多人工的調節和試錯,并且針對不同的測序平臺,也需要進行特異性的配置。而基于深度學習的方法,巧妙的利用了圖像識別領域成熟的技術,不止可以以通用的學習流程達到了現行軟件相同的水平,更獲得了由美國FDA監管的SNP檢測算法比賽的第一名。由于這兩項研究都還處于初期,考慮到深度學習算法巨大的提升空間,在可以預見的未來,基于深度學習的基因檢測算法將會有更大的施展空間。
 而在表觀遺傳學上,深度學習工具DeepCpG則可以根據基因序列預測單細胞層面是否會出現甲基化。在小鼠的胚胎干細胞上驗證后,DeepCpG的表現優于現有的其他軟件。甲基化會影響基因是否表達,而諸多啟動子和增強子(DNA序列中的調控區)與其調控的基因之間的相互作用則會影響基因的表達數量。同樣是基于深度學習的SPEID基于基因序列預測啟動子和增強子之間的相互作用,這是第一個基于基因序列來預測啟動子和增強子的軟件,其效果優于基于基因功能做出的預測。
 傳統的基因組關聯分析(GWAS)大多只能檢測一個點突變(SNP)與所研究疾病的關系,而DeepWAS,這一新提出的框架則能夠根據功能單元,選擇出一組SNP的集合,來更加綜合的研究治病的基因突變,并能直接的尋找調控區域的基因突變。在一項針對抑郁癥的研究中,使用DeepWAS框架的新研究發現了一個新的控制抑郁癥的主要基因MEF2C。
 以上列出的5項研究,都來自與2016年下半年,而在2017年1月,又有一篇基于CNN的文章嘗試預測HLA基因與多肽的相互反應。這些文章雖然都來自于論文預印本,沒有經過正規的同行審查,但不同領域的大規模井噴式爆發,也顯示了該領域的巨大潛力。隨著基因組數據的大量積累,以及深度學習開源平臺的普及,未來深度學習必將成為生物信息領域的“一股清流”,為人類的健康做出貢獻。
  
  

全球化工設備網(http://m.shaipo.cn )友情提醒,轉載請務必注明來源:全球化工設備網!違者必究.

標簽:

分享到:
免責聲明:1、本文系本網編輯轉載或者作者自行發布,本網發布文章的目的在于傳遞更多信息給訪問者,并不代表本網贊同其觀點,同時本網亦不對文章內容的真實性負責。
2、如涉及作品內容、版權和其它問題,請在30日內與本網聯系,我們將在第一時間作出適當處理!有關作品版權事宜請聯系:+86-571-88970062
主站蜘蛛池模板: 油罐车_加油机_加油卷盘_加油机卷盘_罐车人孔盖_各类球阀_海底阀等车用配件厂家-湖北华特专用设备有限公司 | 细沙回收机-尾矿干排脱水筛设备-泥石分离机-建筑垃圾分拣机厂家-青州冠诚重工机械有限公司 | 整合营销推广|营销网络推广公司|石家庄网站优化推广公司|智营销 好物生环保网、环保论坛 - 环保人的学习交流平台 | 成都租车_成都租车公司_成都租车网_众行宝 | 云南成人高考网| 蓄电池回收,ups电池后备电源回收,铅酸蓄电池回收,机房电源回收-广州益夫铅酸电池回收公司 | 耐高温电缆厂家-远洋高温电缆 | 富森高压水枪-柴油驱动-养殖场高压清洗机-山东龙腾环保科技有限公司 | 仓储货架_南京货架_钢制托盘_仓储笼_隔离网_环球零件盒_诺力液压车_货架-南京一品仓储设备制造公司 | 进口消泡剂-道康宁消泡剂-陶氏消泡剂-大洋消泡剂 | 快速门厂家批发_PVC快速卷帘门_高速门_高速卷帘门-广州万盛门业 快干水泥|桥梁伸缩缝止水胶|伸缩缝装置生产厂家-广东广航交通科技有限公司 | 全国国际学校排名_国际学校招生入学及学费-学校大全网 | 定时排水阀/排气阀-仪表三通旋塞阀-直角式脉冲电磁阀-永嘉良科阀门有限公司 | 热缩管切管机-超声波切带机-织带切带机-无纺布切布机-深圳市宸兴业科技有限公司 | 外贸资讯网 - 洞悉全球贸易,把握市场先机 | 波纹补偿器_不锈钢波纹补偿器_巩义市润达管道设备制造有限公司 | 磁力反应釜,高压釜,实验室反应釜,高温高压反应釜-威海自控反应釜有限公司 | 水冷式工业冷水机组_风冷式工业冷水机_水冷螺杆冷冻机组-深圳市普威机械设备有限公司 | 气动隔膜泵-电动隔膜泵-循环热水泵-液下排污/螺杆/管道/化工泵「厂家」浙江绿邦 | 恒温槽_恒温水槽_恒温水浴槽-上海方瑞仪器有限公司 | 青岛美佳乐清洁工程有限公司|青岛油烟管道清洗|酒店|企事业单位|学校工厂厨房|青岛油烟管道清洗 插针变压器-家用电器变压器-工业空调变压器-CD型电抗器-余姚市中驰电器有限公司 | 北京浩云律师事务所-企业法律顾问_破产清算等公司法律服务 | 便携式表面粗糙度仪-彩屏硬度计-分体式粗糙度仪-北京凯达科仪科技有限公司 | YJLV22铝芯铠装电缆-MYPTJ矿用高压橡套电缆-天津市电缆总厂 | 知名电动蝶阀,电动球阀,气动蝶阀,气动球阀生产厂家|价格透明-【固菲阀门官网】 | 佛山商标注册_商标注册代理|专利注册申请_商标注册公司_鸿邦知识产权 | b2b网站大全,b2b网站排名,找b2b网站就上地球网 | 玻纤土工格栅_钢塑格栅_PP焊接_单双向塑料土工格栅_复合防裂布厂家_山东大庚工程材料科技有限公司 | 英思科GTD-3000EX(美国英思科气体检测仪MX4MX6)百科-北京嘉华众信科技有限公司 | 宁夏档案密集柜,智能密集柜,电动手摇密集柜-盛隆柜业宁夏档案密集柜厂家 | 工装定制/做厂家/公司_工装订做/制价格/费用-北京圣达信工装 | 超声波清洗机-超声波清洗设备定制生产厂家 - 深圳市冠博科技实业有限公司 | 台湾阳明固态继电器-奥托尼克斯光电传感器-接近开关-温控器-光纤传感器-编码器一级代理商江苏用之宜电气 | 乐考网-银行从业_基金从业资格考试_初级/中级会计报名时间_中级经济师 | 【铜排折弯机,钢丝折弯成型机,汽车发泡钢丝折弯机,线材折弯机厂家,线材成型机,铁线折弯机】贝朗折弯机厂家_东莞市贝朗自动化设备有限公司 | 日本东丽膜_反渗透膜_RO膜价格_超滤膜_纳滤膜-北京东丽阳光官网 日本细胞免疫疗法_肿瘤免疫治疗_NK细胞疗法 - 免疫密码 | 517瓜水果特产网|一个专注特产好物的网站 | 液晶拼接屏厂家_拼接屏品牌_拼接屏价格_监控大屏—北京维康 | LINK FASHION 童装·青少年装展| 软文发布-新闻发布推广平台-代写文章-网络广告营销-自助发稿公司媒介星 | 耐磨陶瓷,耐磨陶瓷管道_厂家-淄博拓创陶瓷科技 |