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食源性疾病不容小覷基因組測(cè)序技術(shù)助力病情識(shí)別

作者： 2021年06月29日來(lái)源：瀏覽量：

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目前，食源性疾病的發(fā)病率在世界總發(fā)病率中位居前列，成為中國(guó)以及世界上主要的的衛(wèi)生問(wèn)題。世界衛(wèi)生組織認(rèn)為，凡是通過(guò)食物進(jìn)入人體的各種致病因子引起的，具有感染性或中毒性的疾病，都是

　　目前，食源性疾病的發(fā)病率在世界總發(fā)病率中位居前列，成為中國(guó)以及世界上主要的的衛(wèi)生問(wèn)題。世界衛(wèi)生組織認(rèn)為，凡是通過(guò)食物進(jìn)入人體的各種致病因子引起的，具有感染性或中毒性的疾病，都是食源性疾病。也就是說(shuō)，利用食物傳播的方式導(dǎo)致病原體進(jìn)入人體并引起的中毒或感染性疾病都叫食源性疾病。

　　炎炎夏日，氣溫不斷升高，為細(xì)菌增殖創(chuàng)造了條件，食物更容易腐爛變質(zhì)，各種腸道傳染病和食物中毒也在夏季頻頻發(fā)生。

　　這些均屬于食源性疾病，食源性疾病分為三種：食物感染、食物中毒、中毒性感染；食源性疾病與食用某種食物有關(guān)，多為集體暴發(fā)。食源性疾病的典型癥狀包括：惡心、嘔吐、胃痙攣、腹瀉、發(fā)燒等。

　　沙門(mén)氏菌、彎曲桿菌和腸出血性大腸桿菌屬于最常見(jiàn)的食源性病原體，每年影響數(shù)百萬(wàn)人，有時(shí)導(dǎo)致嚴(yán)重和致命后果。癥狀是發(fā)燒、頭痛、惡心、嘔吐、腹痛和腹瀉。沙門(mén)氏菌疫情涉及的食物包括蛋類(lèi)、家禽和其它動(dòng)物源產(chǎn)品。感染彎曲桿菌的食源性病例主要是由原料奶、生的或未煮熟的家禽以及飲用水所導(dǎo)致。腸出血性大腸桿菌與未經(jīng)消毒的牛奶、未做熟的肉類(lèi)以及新鮮水果和蔬菜有關(guān)。此外，還有李斯特菌、霍亂孤菌都是常見(jiàn)的食源性病原體。

　　對(duì)于這一類(lèi)食源性疾病，抗生素對(duì)其治療至關(guān)重要。但是，獸醫(yī)和人類(lèi)醫(yī)學(xué)中過(guò)度用和濫用這類(lèi)藥物與耐藥性細(xì)菌的出現(xiàn)和傳播相關(guān)，致使對(duì)動(dòng)物和人類(lèi)的傳染病治療無(wú)效。

　　隨著生命科學(xué)的研究進(jìn)程加快，專(zhuān)家發(fā)現(xiàn)隨著新一代基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，基于全基因組測(cè)序(WGS)的分子分型技術(shù)在食源性疾病聚集性病例識(shí)別和爆發(fā)溯源調(diào)查中顯示出極大的應(yīng)用價(jià)值和發(fā)展?jié)摿Α?br />

　　在食品安全領(lǐng)域，越來(lái)越多的研究機(jī)構(gòu)和監(jiān)管部門(mén)將全基因組測(cè)序技術(shù)應(yīng)用于食源性疾病疫情爆發(fā)的識(shí)別和監(jiān)測(cè), 并基于此技術(shù)進(jìn)行疾病溯源追蹤和污染調(diào)查等。基于全基因組測(cè)序的分型技術(shù)不僅可以快速檢測(cè)病原菌, 而且具有較高的準(zhǔn)確度和分辨率。

　　我國(guó)搭建了全基因組數(shù)據(jù)計(jì)算云引擎，將標(biāo)準(zhǔn)化的WGS數(shù)據(jù)分析流程轉(zhuǎn)移到云端，大大降低了WGS數(shù)據(jù)分析、運(yùn)算及使用門(mén)檻。還開(kāi)發(fā)了常見(jiàn)食源性致病菌毒力因子、耐藥基因、血清分子分型、wgMLST分析、wgSNP等自動(dòng)化分析功能模塊，有助于各級(jí)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展食源性微生物遺傳與變異特征、致病和耐藥機(jī)制及菌株進(jìn)化等方面的基礎(chǔ)研究。

　　食源性疾病的研究任重而道遠(yuǎn)，盡管科學(xué)在進(jìn)步但仍然有很多疑難問(wèn)題亟待解決，我們相信隨著社會(huì)的發(fā)展，科研的深入，這些問(wèn)題終將會(huì)被一一攻克。

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